Título: Bacterias comensales de la leche materna: efectos en prematuros y en neonatos de madres seropositivas (VIH). Selección de cepas y aplicación en nuevos alimentos funcionales infantiles. Referencia: AGL2005-01138
Entidad financiadora: Ministerio de Educación y Ciencia
Duración, desde: 2005 hasta: 2008
Investigador principal: Juan Miguel Rodríguez Gómez

Título: Acción Especial para la continuidad de la red temática: “Participación de las bacterias lácticas en la salud humana y calidad alimentaria”.
Entidad financiadora: Ministerio de Educación y Ciencia
Duración, desde: 2006 hasta: 2008
Coordinador: Gaspar Pérez Martínez

Título: Influencia de la leche materna en la evolución de la microbiota intestinal infantil. Efecto de la administración de un alimento probiótico a niños destetados sanos y a madres con mastitis. Referencia: AGL2007-62042
Entidad financiadora: Ministerio de Educación y Ciencia
Duración, desde: 2007 hasta: 2010
Investigador principal: Juan Miguel Rodríguez Gómez

Título: Nuevos Ingredientes de Alimentos Funcionales para Mejorar la Salud (FUN-C-FOOD). CONSOLIDER-INGENIO 2010. Referencia: CSD2007-00063
Entidad financiadora: Mº de Educación y Ciencia
Duración, desde: 2007 hasta: 2013
Investigador principal: Francisco Tomás Barberán

Título: Influencia de la leche materna en la evolución de la microbiota intestinal infantil. Efecto de la administración de un alimento probiótico a niños destetados sanos y a madres con mastitis. Referencia: CCG07-UCM/AGR-2488
Entidad financiadora: Comunidad de Madrid
Duración: 2008
Investigador principal: Juan Miguel Rodríguez Gómez

Título: La microbiota comensal en el periodo perinatal y su aplicación en alimentación infantil
Entidad financiadora: Comunidad de Madrid
Duración: 2009-2010
Investigador principal: Juan Miguel Rodríguez Gómez

Título: Actividades glicosidásicas de bacterias lácticas y bifidobacterias con interés tecnológico y probiótico
Entidad financiadora: INIA (Recursos Microbianos. Acciones Complementarias tipo e) de Apoyo a la Conservación de los Recursos Genéticos de Interés Agroalimentario). Ref. RM2009-00009-00-00
Duración: Enero, 2010,-Diciembre, 2011
Investigador principal: Susana Delgado Palacio

Título: Acción Especial para la continuidad de la red temática: “Participación de las bacterias lácticas en la salud humana y calidad alimentaria”.
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación
Duración, desde: 2009 hasta: 2010
Coordinador: Gaspar Pérez Martínez (IATA, CSIC)

Título: ALIBIRD. Diseño y Validación de Ingredientes Activos para el Desarrollo de Alimentos Funcionales. Ref. S2009/AGR-1469
Entidad financiadora: Comunidad de Madrid (Convocatoria de ayudas a grupos para el desarrollo de programas de actividades de I+D de entre grupos de investigación de la Comunidad de Madrid en tecnologías)
Duración, desde: 01/2010 hasta: 2013
Coordinador: Guillermo Reglero (UAM)

Título: Incorporación de nuevos ingredientes funcionales a alimentos como contribución a la promoción de la salud y/o a la prevención de enfermedades de la población Iberoamericana
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación (Convocatoria CYTED. Acción de Coordinación de Proyectos de Investigación)
Duración, desde: 2010 hasta: 2012
Coordinador: Javier Fontecha (CIAL, UAM-CSIC)

Título: Aplicación de técnicas –ómicas para evaluar los efectos de probióticos en parejas madre-hijo expuestas a antibioterapia en el periparto. Referencia: AGL2010-15420
Entidad financiadora: Ministerio de Educación y Ciencia
Duración, desde: 2010 hasta: 2013
Investigador principal: Juan Miguel Rodríguez Gómez

Título: The role of human milk in development of breast fed child's intestinal microbiota. Ref: J4-3606
Entidad financiadora: ARRS (Slovenian Research Agency)
Duración: 2010-2013 (36 meses)
Investigador principal: Irena Rogelj (University Medical Centre Ljubljana, Division of Paediatrics, Eslovenia)
Otros grupos participantes: Dr. von Hauner Children’s Hospital, Alemania (responsable: Berthold Koletzko), UCM (responsable: Juan Miguel Rodríguez Gómez), Harvard Medical School, Boston, Massachussets, USA (responsable: Eric Ding)

Título: La microbiota comensal en el periodo perinatal y su aplicación en alimentación infantil.
Entidad financiadora: Comunidad de Madrid
Duración: 2011
Investigador principal: Juan Miguel Rodríguez Gómez

Título: Acción Complementaria “Alimentación y salud humana”.
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación
Duración, desde: 2011 hasta: 2013
Coordinador: Mª Isidra Recio (CIAL, CSIC-UAM)